Анализ растра активности

Детектирование импульсов активности

Для детектирования спонтанных импульсов, полученных на системе MED64, используется методы, описанные в пунктах 3.2 и 3.3. При нажатии на кнопку "Detect Spikes" появляется диалоговое окно выбора файла. Анализируемый файл должен иметь расширение ".med". Программа поочерёдно выделяет времена возникновения импульсов по всем электродам, формируя растровую диаграмму (Рис. 4.2). Таблица с временами возникновения импульсов на всех электродах сохраняется в отдельную папку в виде файла растра с расширением ".txt".

Рисунок 4.2. Представление растровой диаграммы.

Для представления растра активности, полученного на предыдущем шаге, используется частотно-временная диаграмма. Данная диаграмма вычисляется следующим образом: активность делится на временные промежутки времени, установленные в поле "Time bin (ms)" (по умолчанию 50 мс), для каждого промежутка времени вычисляется суммарное количество импульсов на всех электродах (Рис. 4.3). Функция построения частотно-временной диаграммы выполняется с помощью кнопки "SpikeRate plot". Анализируемый файл должен иметь расширение ".med".

Рисунок 4.3. Частоно-временная диаграмма активности культуры клеток.

Дата добавления: 2014-12-25