C1ccccc1n2ccccc2

Один атом может входить в состав одновременно нескольких циклов. Так для кубанов один и тот же атом углерода может попасть на «вход» сразу в нескольких циклах:

C12C3C4C1C5C4C3C25

Для морфина код SMILES выглядит следующим образом:

O1C2C(O)C=CC3Cc2(C4)Cc5c1c(O)ccc5CC3N(C)C4

Морфин

Изомеры в SMILES

Изотопы указываются в квадратных скобках.

[12C]	Изотоп углерода-12
[13C]	Изотоп углерода-13
[C]	Углерод (без указания изотопного состава)
[13CH4]	^13C-меченный метан

Конфигурация относительно двойной связи записывается при помощи символов / и \. Например, F/C=C/F соответствует транс-дифторэтилену, а F/C=C\F или F\C=C/F соответствует цис-дифторэтилену.

	F/C=C/F F\C=C\F E-дифторэтен
	F/C=C\F F\C=C/F Z-дифторэтен
	F/C=C/C=C/C
	F/C=C/C=CC
	NC(C)(F)C(=O)O NC(F)(C)C(=O)O
	N[C@](C)(F)C(=O)O N[C@@](F)(C)C(=O)O
	N[C@@]([H])(C)C(=O)O N[C@@H](C)C(=O)O N[C@H](C(=O)O)C [H][C@](N)(C)C(=O)O [C@H](N)(C)C(=O)O
	N[C@]([H])(C)C(=O)O N[C@H](C)C(=O)O N[C@@H](C(=O)O)C [H][C@@](N)(C)C(=O)O [C@@H](N)(C)C(=O)O
	C[C@H]1CCCCO1 O1CCCC[C@@H]1C

Дата добавления: 2015-06-04