Соотношение фенотипических групп и отделов бактерий

Лекция 3

(часть лекции)

Вопросы:

1. Путь идентификации бактерий в определители Берджи.

2. Фенотипические признаки, используемые при идентификации бактерий до группы, их иерархия.

3. Соотношение фенотипических групп и отделов бактерий. Группы категории Меndosicutes (Archaeobacteria). Группы категории Firmicutes. Группы категории Tenericutes. Группы категории Gracilicutes.

4. Разнообразие типов питания (физиологические группы) и их соотношение с отделами бактерий.

Идентификация бактерий в определителе Берджи (Bergey’s manual of systematic bacteriology) идет по пути основная категория – группа – подгруппа – род – вид. Путь идентификации и путь классификации отличаются. В классификации имеются такие категории, как отдел, класс, подкласс, порядок, семейство. Эти таксоны описываются в основном молекулярно-генетическими признаками, поэтому из пути идентификации по фенотипу выпадают. Справочным источником по современной филогенетической классификации бактерий является сайт J.P. Euzéby: Classification of prokaryotes.

Фенотипические признаки, используемые при идентификации бактерий до группы. Фенотипические признаки имеют свою иерархию, т.е. тот порядок, в котором они берутся в процессе определения бактерий до группы.

A. Морфология.

1. Форма клетки / наличие выростов на клетке (простеки, стебельки, нити, ленты).

2. Тип деления (почкование клеток).

3. Наличие чехлов, окружающих клетки.

4. Образование плодовых тел.

5. Образование эндоспор.

Б. Физиология.

6. Подвижность / расположение жгутиков.

7. Отношение к кислороду.

8. Тип движения (скользящее движение). Скользящее движение – передвижение по твердому субстрату без помощи жгутиков.

9. Тип питания, например:

a) осуществление оксигенного/аноксигенного фотосинтеза;

б) хемолитотрофия;

в) облигатный внутриклеточный паразитизм;

г) роль соединений серы в обмене веществ (напр., использование серы или ее окисленных соединений в качестве конечного акцептора электронов);

д) образование метана из водорода и углекислого газа;

е) сульфатредукция – образование сероводорода из сульфата.

9. Развитие в экстремальных условиях:

а) в условиях экстремального засоления;

б) экстремальная термофилия.

Фенотипическая группа 13: Почкующиеся и/или образующие выросты бактерии

Фенотипическая группа 16: Скользящие бактерии, образующие плодовые тела, или миксобактерии Особенностью миксобактерий является их способность коллективно лизировать твердые частицы с помощью гидролитических ферментов. Часть из них обладает протеолитической способностью и лизирует клетки бактерий, попадающие под скользящую колонию (шварм). Поэтому миксобактерий относят к хищным бактериям.     Фенотипические группы архебактерий: Помимо филогенетических групп (филумов) археи делят на физиолого-морфологические группы: - метаногенные; - сульфатредуцирующие; - экстремально галофильные; - экстремально термофильные S^0 метаболизирующие; - лишенные клеточной стенки.

Отношение к кислороду:

Аэробы облигатные ‒ разнородная группа микроорганизмов, использующих аэробный (окислительный) тип биологического окисления субстратов. Метаболизм облигатных анаэробов осуществляется только при наличии в среде обитания достаточно высокой концентрации свободного кислорода, который выполняет функцию конечного акцептора отнятых от субстрата электронов.

Микроаэрофилы ‒ группа микроорганизмов, которые растут при сниженном по сравнению с аэробами парциальном давлении кислорода, но не растут в анаэробных условиях.

Анаэробы ‒ микроорганизмы, развивающиеся при отсутствии в окружающей их среде свободного кислорода. Факультативные анаэробы (=факультативные аэробы), облигатные анаэробы.

Дата добавления: 2014-01-07