Особенности инициации на вирусных РНК

Вирусы обычно используют свои способы. Им нужно направить весь синтез на собственные белки. Они используют внутреннюю посадку рибосомы на последоватьльности IRESes, internal ribosome entry sites;

Часто у вирусов все синтезируется в форме полибелка. У пикорнавирусов 5" конец начинается с длинной нетранслируемой области около 600 нт, которая складывается в структуру, которая обнимает 40ку (IRES). при этом АУГ оказывается внутри нее. Потом она использует часть обычных факторов, чтобы продвинуться.

У вируса паралича сверчка есть домен РНК, связывающийся в структуру, похожую на тРНК, который садится на ССУ кодон(пролиновый) в Р-участок. И ждет пока подойдет нужная тРНК. Потом все идет с участием классических фактороф элонгации.

Схема внутренней инициации трансляции РНК вируса паралича сверчка:

(1) Домен IRES’a занимает Р-участок рибосомы вместо инициаторной тРНК, садясь на пролиновый CCU-кодон (имитация инициаторной тРНК!)

(2) 60S субъединица присоединяется к инициирующей 40S субъединице.

(3) Ala-tRNA занимает А-участок, садясь на свой GCU-кодон.

(4) Происходит транслокация Ala-tRNA из А в Р участок.

(5) На вакантный А-участок садится Thr-tRNA, в соответствии с АСА-кодоном,
и начинается трансляция.

Регуляция трансляции
у эукариот:

мРНК-специфическая негативная регуляция

(трансляционная репрессия)

В эукариотном комплексе есть репрессорный белок, который стабилизирует спираль на5"конце, чтобы не давать рибосоме сесть.

Есть 2 способа репрессии:

1. Спираль стабилизированная белком может находится возле кэпа, и не дает рибосоме сесть.

2. Спираль находится в нетранслируемой области. Рибосома рано или позно утыкается в спираль и не может ехать дальше.

Наприер, регуляция синтеза ферритина.

Ферритин связывает 3хвалентное железо. Оно вообще хранится с ним в комплексе.

У мРНК ферритина возле 5"конца есть репрессорная шпилька, которая называется IRE. При недостатке железа белок IRE-BP (-binding protein) cадится на шпильку и стабилизирует ее. Поэтому 40ка не может сесть на РНК. При избытке железа IRE-BP кластеризуется и образует аконитазу с железо-серным кластером. Шпилька при этом нестабильна, трансляция происходит.

Тотальная негативная регуляция у эукариот. О ней он говорит коротко, потому что она есть в учебнике.

Если нет железа, то гемоглобин вырабатывать не имеет смысла, и остальные белки - тоже, значит происходит глобальная репрессия синтеза всех белков в ретикулоцитах. Репрессия соповождается обильным фосфорилированием факторов инициации, особенно второго. Там все непонятно. Тут в дейстие вступает фактор2В. Была даже статья "2В or not 2В". функция 2В до конца не понятна. Зачем ему 5 субьединиц.

....Тут не все слышно, только отдельные куски, из котрых мало что понятно. Похоже он просто пересказывает рисунок:

2В призван заменять ГДФ на ГТФ во втором факторе. Он туда садится, привлекает ГТФ. Если 2В фосфорилирован (сер51, это происходит при недостатке железа, тепл. шоке, голодании, внутренней инфекции), то комплекс с ГТФ не распадается. Вся активность фактора второго - связана в нераспадающемся комплексе (красная полоска поперек стрелки).

2 схемы - как работает киназа. Спирин опять бубнит.

Активная форма - диссоциированная. Неактивная форма скреплена гемом. Уход гема. Автофосфорилирование.

Признак голодания, когда нет АК - наличие неаминоацилированых тРНК. Они как-то активируют киназы. Происходит фосфорилирование. Активируются киназы.Фосфокиназа фосфорилирует фактор 2. происходит регуляция ГТФ на факторе 2.

Дата добавления: 2014-01-07