Создание Циклогексана в форме твист- ванны

Вторичное измерение расстояний между аксиальными Водородами

1. L-щелчок на двух осевых водородах.

Линия состояния показывает новое расстояние " Н-Н " (2. 28Å). Минимизация энергии слегка сгладила структуру и переместила два осевых водорода обособленно друг от друга.

Оптимизированная структура ванны - седловая точка. Плоскость симметрии в структуре старта балансирует весь перпендикуляр сил к этой плоскости. Поиски направления оптимизации основаны на этих силах, и поэтому, все направления поиска имеют ту же самую плоскость симметрии. HYPERCHEM находит седловую точку, которая является minimum относительно всех расстояний кроме плоскости симметрии.

Третья форма циклогексана, форма твист - ванны, является истинным локальным минимумом. Простой способ получить её состоит в том, чтобы слегка изменить форму ванны, накладывая новую торзионную связь, затем провести восстановление при оптимизацию структуры.

Устанавливать торзионную связь:

1. R - щелкнуть в пустой области рабочего пространства, чтобы очистить выбор.

2. Выключить Show Hydrogens.

3. Выбрать торзионный угол из четырех атомов углерода, выбирая связи в этом порядке: 6-1, 1-2, и 2-3.

Model Builder вычисляет конфигурации согласно порядку выбора.

4. Выбрать Constrain Bond Torsion на меню Build, выберите Other, и назначьте значение 30, чтобы установить связь в 30 градусов. Затем нажмите OK.

5. R-щелчок в пустой области рабочего пространства.

Торзионный выбор отменяется, но связь еще не установлена.

Восстановить молекулу с торзионной связью:

1. Сделайте двойной щелчок на инструменте Selection, чтобы вызвать Model Builder.

HYPERCHEM восстанавливает структуру с торзионной связью, чтобы создать каноническую форму твист - ванну циклогексана.

Дата добавления: 2014-01-11