III) По полярности бокового радикала

I) По химической природе радикала

1) Алифатические a–аминокислоты составляют наиболее многочисленную группу: Gly, Ala, Val, Leu, ILe, Ser, Thr, Asp, Glu, Asn, Gln, Lys, Arg, Cys, Met.

2) Ароматические и гетероциклические: Phe, Tyr, Trp, His, Pro. Циклы отделены от a–аминокислотного фрагмента группой –СН₂–. Это позволяет свободное вращение циклов при формировании пространственной структуры белка.

II) По числу групп –СООН и –NH₂ в молекуле

1) Нейтральные или моноаминомонокарбоновые (1–СООН и 1–NH₂): Gly, Ala, Val и т.д.

2) Основные или диаминомонокарбоновые (1–СООН и 2–NH₂): Lys, Arg.

3) Кислые или моноаминодикарбоновые (2–СООН и 1–NH₂): Glu, Asp.

1) a–аминокислоты с неполярным (гидрофобным) радикалом: Ala, Leu, Val и т.д.

2) a–аминокислоты с полярным радикалом (гидрофильным), содержащим полярные группировки (ОН–, SH–, COOH–, NH₂–):

а) ионогенные – способные к ионизации в условиях организма, например, фенольный гидроксил тирозина.

б) неионогенные – неспособные переходить в ионное состояние в организме, например, спиртовый гидроксил серина.

В белках ионогенные группы располагаются на поверхности и обуславливают электростатическое взаимодействие. Неионогенные располагаются как на поверхности белка, так и внутри и образуют водородные связи. Таким образом, и те и другие участвуют в формировании пространственной структуры белка.

Стереоизомерия a–аминокислот.

Все a–аминокислоты, кроме глицина, имеют центр хиральности и потому оптически активны.

СООН СООН Принадлежность к D– и L– ряду

определяют по глицериновому

Н – С* – NH₂ NH₂ – С* – Н альдегиду.

R R

D–a–аминокислота L–a–аминокислота

Энантиомеры

Почти все природные a–аминокислоты относятся к L–ряду, а в построении белков организма участвуют только L–a–аминокислоты. С этим связана стереоспецифичность ферментов: они состоят из L–a–аминокислот и расщепляют белки, состоящие только из L–a–аминокислот. Расщепление же белков из D–a–аминокислот ферментативно невозможно. По этой причине ферменты животных и человека абсолютно бессильны перед вирусом «сибирской язвы», так как в состав белка вируса входит D–глутаминовая кислота.

Дата добавления: 2014-01-07