Студопедия

КАТЕГОРИИ:


Архитектура-(3434)Астрономия-(809)Биология-(7483)Биотехнологии-(1457)Военное дело-(14632)Высокие технологии-(1363)География-(913)Геология-(1438)Государство-(451)Демография-(1065)Дом-(47672)Журналистика и СМИ-(912)Изобретательство-(14524)Иностранные языки-(4268)Информатика-(17799)Искусство-(1338)История-(13644)Компьютеры-(11121)Косметика-(55)Кулинария-(373)Культура-(8427)Лингвистика-(374)Литература-(1642)Маркетинг-(23702)Математика-(16968)Машиностроение-(1700)Медицина-(12668)Менеджмент-(24684)Механика-(15423)Науковедение-(506)Образование-(11852)Охрана труда-(3308)Педагогика-(5571)Полиграфия-(1312)Политика-(7869)Право-(5454)Приборостроение-(1369)Программирование-(2801)Производство-(97182)Промышленность-(8706)Психология-(18388)Религия-(3217)Связь-(10668)Сельское хозяйство-(299)Социология-(6455)Спорт-(42831)Строительство-(4793)Торговля-(5050)Транспорт-(2929)Туризм-(1568)Физика-(3942)Философия-(17015)Финансы-(26596)Химия-(22929)Экология-(12095)Экономика-(9961)Электроника-(8441)Электротехника-(4623)Энергетика-(12629)Юриспруденция-(1492)Ядерная техника-(1748)

Применение в биологии




Методы кластеризации.

Цели кластеризации.

· Осознание данных путём раскрытия кластерной структуры. Разбиение подборки на категории похожих объектов дозволяет облегчить последующую обработку данных и принятия решений, применяя к любому кластеру собственный способ анализа.

· Сжатие данных. Когда начальная подборка избыточно большая, то можно уменьшить её, оставив по одному наиболее типичному представителю от каждого кластера.

· Обнаружение новизны. Отличаются нетипичные объекты, которые не удаётся присоединить ни к одному из кластеров.

В первом случае количество кластеров стараются сделать поменьше. Во втором случае главнее обеспечить высшую ступень однообразия объектов внутри каждого кластера, а кластеров быть может сколько угодно. В третьем случае больший интерес предполагают отдельные объекты, не вписывающиеся ни в один из кластеров.

Во всех этих вариантах имеет возможность применяться иерархическая кластеризация, когда большие кластеры дробятся на более маленькие, те к тому же дробятся ещё мельче, и т. д.

Принятой систематизации методов кластеризации не существует, хотя можно выделить ряд групп подходов.

· Вероятностный подход.

Подразумевается, что любой рассматриваемый объект относится к одному из k классов. Некие создатели считают, что эта категория совсем не имеет отношения к кластеризации и противопоставляют её под названием «дискриминация», то есть выбор отнесения объектов к одной из известных групп (обучающих выборок).

· Подходы на основе систем искусственного интеллекта: очень относительная категория, потому что способов большое количество и методически они различны.

· Логический подход. Возведение дендрограммы исполняется при помощи дерева решений.

· Иерархический подход. Подразумевается наличие вложенных групп (кластеров разного порядка).

В биологии кластеризация имеет огромное количество приложений в самых различных областях. К примеру, в биоинформатике при помощи неё анализируются трудные сети взаимодействующих генов, состоящие иногда из сотен либо в том числе и тысяч частей. Кластерный анализ разрешает выделить подсети, узкие места, концентраторы и прочие скрытые характеристики изучаемой системы, что разрешает, в конечном счете, выяснить вклад каждого гена в составление изучаемого феномена.

В сфере экологии повсеместно используется для выделения пространственно однородных групп организмов, сообществ и т. п. Реже методы кластерного анализа используются для исследования сообществ во времени. Гетерогенность структуры сообществ приводит к появлению нетривиальных методов кластерного анализа.





Поделиться с друзьями:


Дата добавления: 2015-08-31; Просмотров: 662; Нарушение авторских прав?; Мы поможем в написании вашей работы!


Нам важно ваше мнение! Был ли полезен опубликованный материал? Да | Нет



studopedia.su - Студопедия (2013 - 2024) год. Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав! Последнее добавление




Генерация страницы за: 0.008 сек.